Conserva la importante colección bibliográfica de Menéndez Pelayo, donada a la ciudad de Santander por el escritor, con unos 41.500 volúmenes, muchos de ellos de gran valor, destacando la famosa Crónica Troyana, de finales del siglo XIII-comienzos del XIV, bellamente iluminado.
La biblioteca, de estilo historicista, fue realizada por L. Rucabado, utilizándo motivos de inspiración herrerianos. Enfrente de la biblioteca está la estatua sedente de M. Menéndez Pelayo, en mármol blanco, obra de M. Benllure. Frente al jardín, está la casa de Menéndez Pelayo, que es una casa de estilo francés, construida en 1876, con enseres de los hermanos Menéndez Pelayo (Marcelino y Enrique).